Sau khi Công dân/Doanh nghiệp nộp hồ sơ dịch vụ công trực tuyến. Ở màn hình hiển thị thông tin chi tiết hồ sơ hoặc thông báo kết quả nộp hồ sơ thành công, Công dân/Doanh nghiệp nhấn nút Thanh toán phí/lệ phí.

Xác định mục phí/lệ phí cần thanh toán. Chọn hình thức thanh toán là Chuyển khoản qua ngân hàng(Công dân/Doanh nghiệp hoàn thành nghiệp vụ chuyển khoản qua ngân hàng với thông tin đơn vị thụ hưởng trước khi thực hiện bước này)

Chọn tệp tin chứng từ số(biên lai chuyển tiền, ủy nhiệm chi,..) chứng minh đã thanh toán ở mục Hóa đơn thanh toán. Sau đó nhấn vào nút Lưu ở bên dưới màn hình để đăng tải(upload) lên hệ thống.

Hệ thống ghi nhận và thông báo mục phí/lệ phí đã thanh toán đang ở trạng thái chờ cán bộ ở đơn vị nhận hồ sơ kiểm tra và xác nhận.